Lo que se considera como la fase aguda de la enfermedad dura entre 1 o 2 semanas, con desaparición gradual o mismo súbita de los síntomas y de la fiebre durante este período. Así mismo, algunas personas pueden llegar a tardar meses en recuperarse totalmente de esta situación.
Los daños permanentes que puede ocasionar una encefalitis son, ante todo, a nivel de:
- La audición
- La memoria
- El control muscular
- El lenguaje
- La sensibilidad
- La visión
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